Удостоверяющий центр КЦ НАУФОР был создан с целью предоставить участникам финансового рынка максимально удобный и надежный способ отправки отчетности в электронном виде в Федеральную службу по финансовым рынкам (в настоящее время Банк России).

Соответствующее соглашение о взаимодействии с ФСФР России было заключено в 2007 году.

В 2013 году КЦ НАУФОР был аккредитован в качестве удостоверяющего центра Министерством связи и массовых коммуникаций РФ.

Аккредитация в соответствии с Федеральным законом от 06.04.2011 № 63-ФЗ "Об электронной подписи" подтвердила соответствие КЦ НАУФОР всем новеллам законодательства об электронной подписи и позволила оказывать уникальные услуги не только участникам финансового рынка, но и всем юридическим лицам, заинтересованным в электронном взаимодействии в том числе с органами исполнительной власти, в частности, через портал государственных услуг.

В работе Удостоверяющего центра КЦ НАУФОР используются только сертифицированные средства криптографической защиты.